RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	ENDOD1	O94919	500 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	YWHAQ	P27348	245 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PTPN7	P35236	360 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PPM1A	P35813	382 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PTGIR	P43119	386 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TAF10	Q12962	218 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	LIAS	O43766	372 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SEC24A	O95486	1093 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	GOT1	P17174	413 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	GGCX	P38435	758 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TAZ	Q16635	292 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SCML4	Q8N228	414 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RAD9A	Q99638	391 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	F9	P00740	461 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ATF2	P15336	505 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ADRA1B	P35368	520 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	P3H4	Q92791	437 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	CASP10	Q92851	521 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TEX28	O15482	410 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TBX18	O95935	607 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	GAS8	O95995	478 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ARL4A	P40617	200 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PRRG1	O14668	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	IFNB1	P01574	187 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	APOC2	P02655	101 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MYOG	P15173	224 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TFDP2	Q14188	446 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RASIP1	Q5U651	963 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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