RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 CUL2Q13617 745 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FGL2Q14314 439 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TEAD2Q15562 447 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 KCTD16Q68DU8 428 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 A8MUI8 341 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SHHQ15465 462 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MLIPQ5VWP3 458 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 RINLQ6ZS11 566 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 NUF2Q9BZD4 464 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM117AQ9C073 453 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CLPBQ9H078 707 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 LHX5Q9H2C1 402 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ATP9AO75110 1047 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 HOXB2P14652 356 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ADIGQ0VDE8 80 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 IRF7Q92985 503 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CEP72Q9P209 647 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 F9P00740 461 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CTPS1P17812 591 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 GJB7Q6PEY0 223 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 DEFB106AQ8N104 65 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FBXL18Q96ME1 805 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 RERGLQ9H628 205 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ZBTB22O15209 634 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MYBL1P10243 752 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 VSIG1Q86XK7 387 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SCAIQ8N9R8 606 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 EXOC2Q96KP1 924 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 USP27XA6NNY8 438 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FNTAP49354 379 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ANTXR2P58335 489 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 KRT71Q3SY84 523 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TMC2Q8TDI7 906 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM3CQ92520 227 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 STMN2Q93045 179 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ACKR2O00590 384 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SERPING1P05155 500 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 OR56A5P0C7T3 313 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 HNF1BP35680 557 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 RGS4P49798 205 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CLCNKBP51801 687 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MNAT1P51948 309 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 RCN2Q14257 317 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ELFN1P0C7U0 828 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ACTR1BP42025 376 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ALDH9A1P49189 494 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ACTR1AP61163 376 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.57□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms