RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 LRRD1A4D1F6 860 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 FGGP02679 453 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 DESP17661 470 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 PSEN1P49768 467 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 LRRC3Q9BY71 257 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 IL21Q9HBE4 155 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 NR2E1Q9Y466 385 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 TLR5O60602 858 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 NRIP1P48552 1158 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 EFEMP1Q12805 493 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 BOLA3Q53S33 107 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 TLE6Q9H808 572 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.22■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 IRAK2O43187 625 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 F11P03951 625 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 CXCR3P49682 368 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ARSEP51690 589 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ADCY2Q08462 1091 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ITIH5Q86UX2 942 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 TMC8Q8IU68 726 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CNN3-202ENST00000394202 ZMYND10O75800 440 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RALAP11233 206 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 KRT10P13645 584 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 KDELR1P24390 212 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 CCDC181Q5TID7 509 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 GAREM2Q75VX8 874 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 KCTD6Q8NC69 237 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 FZD10Q9ULW2 581 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 ASB3Q9Y575 518 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 C2orf78A6NCI8 922 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 F9P00740 461 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 MMRN1Q13201 1228 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 MIB1Q86YT6 1006 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 TEKT4Q8WW24 435 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 ADRA1BP35368 520 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 CDKN2BP42772 138 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 CDH6P55285 790 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 DUSP6Q16828 381 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 CORO1BQ9BR76 489 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RNF38Q9H0F5 515 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 ZNF576Q9H609 170 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 WDCPQ9H6R7 721 aa24.19■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 IL4RP24394 825 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 L1CAMP32004 1257 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RNF14Q9UBS8 474 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 COCHO43405 550 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 C1RP00736 705 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 GABRR2P28476 465 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 GBP1P32455 592 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 PAFAH1B1P43034 410 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 DPYSL3Q14195 570 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 KAZNQ674X7 775 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RNF34Q969K3 372 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 CALN1Q9BXU9 219 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CNN3-202ENST00000394202 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms