RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GLTPD2A6NH11 291 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CD19P15391 556 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PPP3CCP48454 512 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 OCRLQ01968 901 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ARL5BQ96KC2 179 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ING3Q9NXR8 418 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PEAK1Q9H792 1746 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PRR23AA6NEV1 266 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PRSS44E7EML9 344 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 G0S2P27469 103 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CBX5P45973 191 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 NT5C2P49902 561 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ENTPD1P49961 510 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 MYBPC1Q00872 1141 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PP2D1A8MPX8 630 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CLOCKO15516 846 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 UBL4AP11441 157 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 MAPK10P53779 464 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 NCKAP1LP55160 1127 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZNF543Q08ER8 600 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GRM4Q14833 912 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 HES5Q5TA89 166 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 FAM13CQ8NE31 585 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SNX12Q9UMY4 172 aa14.1□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TMEM120BA0PK00 339 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SPOPO43791 374 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PSAPP07602 524 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PRKAR1BP31321 381 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CDH19Q9H159 772 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 VPS33BQ9H267 617 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CD274Q9NZQ7 290 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZNF254O75437 659 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CD4P01730 458 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 LGALS3BPQ08380 585 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ZNF846Q147U1 533 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 LRRC41Q15345 812 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 EPC2Q52LR7 807 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CAVIN3Q969G5 261 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 NPHS2Q9NP85 383 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SNX3O60493 162 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 KCNJ13O60928 360 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 GPR85P60893 370 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 VAC14Q08AM6 782 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 DTX3Q8N9I9 347 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.08□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 ASB14A6NK59 587 aa14.08□□□□□ -0.15
CTIF-202ENST00000382998 APOL3O95236 402 aa14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms