RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRK-201ENST00000368202 TRPC7Q9HCX4 862 aa12.68□□□□□ -0.38
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PTPRK-201ENST00000368202 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
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PTPRK-201ENST00000368202 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
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PTPRK-201ENST00000368202 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.67□□□□□ -0.38
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PTPRK-201ENST00000368202 F11P03951 625 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 HMBSP08397 361 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 CTAGE8P0CG41 777 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 KDELR1P24390 212 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 CXCR3P49682 368 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRK-201ENST00000368202 PGFP49763 221 aa12.65□□□□□ -0.38
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