RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 H7C1Q1 480 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 AP4M1O00189 453 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CYR61O00622 381 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ELFN1P0C7U0 828 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 EBLN1P0CF75 366 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 C6P13671 934 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DRD1P21728 446 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLRK1P26718 216 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DUSP1P28562 367 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CXCR5P32302 372 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 MCM5P33992 734 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CACNA2D1P54289 1103 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 PNLIPRP1P54315 467 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 INHBCP55103 352 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP10-2P60368 255 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CFHR3Q02985 330 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 POU5F1BQ06416 359 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC15Q0P6D6 951 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LCE4AQ5TA78 99 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTC22Q5TAA0 569 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ANKRD45Q5TZF3 282 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CEP85Q6P2H3 762 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACSM6Q6P461 480 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 Q6ZPA2 131 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 MOGAT3Q86VF5 341 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 P3H2Q8IVL5 708 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM71DQ8N9W8 422 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 BEND2Q8NDZ0 799 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 GLMPQ8WWB7 406 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNX18Q96RF0 628 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DUSP26Q9BV47 211 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 VPS16Q9H269 839 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 MLXIPQ9HAP2 919 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LPAR3Q9UBY5 353 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DAPP1Q9UN19 280 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 A0A087X1B8 175 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 HMX3A6NHT5 357 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTC34A8MYJ7 566 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 BTBD19C9JJ37 291 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 H0Y3Z8 333 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 H3BNC9 293 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 NKX2-8O15522 239 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 SEPT4O43236 478 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAMP2O60895 175 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 RPP40O75818 363 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 JTBO76095 146 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CER1O95813 267 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LMNAP02545 664 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TK1P04183 234 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 CYP3A4P08684 503 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ENGP17813 658 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRT4P19013 534 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DRD4P21917 467 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 SERPINA4P29622 427 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 AKT1P31749 480 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACVRL1P37023 503 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 GDF5P43026 501 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DIO1P49895 249 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACTR2P61160 394 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TLE3Q04726 772 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DPTQ07507 201 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 LMAN2Q12907 356 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 BFSP2Q13515 415 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM187BQ17R55 369 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 P3H1Q32P28 736 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ALFQ53S48 1182 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCID2Q5JVF3 399 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRHL2Q6ISB3 625 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF627Q7L945 461 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 MRGPRGQ86SM5 289 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms