RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DNAI1Q9UI46 699 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OTOFQ9HC10 1997 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQH9 124 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CLGNO14967 610 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KRT1P04264 644 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CYP3A5P20815 502 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB6P35237 376 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A3P53794 718 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 GTF2BQ00403 316 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MCL1Q07820 350 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SPEM2Q0P670 501 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM15Q13444 863 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD6Q15008 389 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN21Q16825 1174 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 UNC93AQ86WB7 457 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PCED1BQ96HM7 432 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CENPHQ9H3R5 247 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SCAMP1O15126 338 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KAT7O95251 611 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TBX18O95935 607 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CEBPBP17676 345 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TUBP50607 506 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CDH6P55285 790 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ACOX1Q15067 660 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF284Q2VY69 593 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C2CD6Q53TS8 623 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CNGA4Q8IV77 575 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 KLHL3Q9UH77 587 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 NEMP2A6NFY4 417 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 F8W810 466 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 RAMP2O60895 175 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF9O75901 435 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GPR15P49685 360 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CENPCQ03188 943 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TNK2Q07912 1038 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CENPPQ6IPU0 288 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 DEFB106AQ8N104 65 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 WHAMMQ8TF30 809 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TCEAL4Q96EI5 215 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DERAQ9Y315 318 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SCINQ9Y6U3 715 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.6□□□□□ -1.67
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