RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 HES6Q96HZ4 224 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 BEX3Q00994 111 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZNF384Q8TF68 577 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TINF2Q9BSI4 451 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 EGFRP00533 1210 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PRELID2Q8N945 189 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SNX31Q8N9S9 440 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SEPT8Q92599 483 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 GID8Q9NWU2 228 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RBL1P28749 1068 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KCNK10P57789 538 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SGO1Q5FBB7 561 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 APBB2Q92870 758 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KCNK1O00180 336 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TTMPQ5BVD1 217 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CCDC126Q96EE4 140 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RRAGCQ9HB90 399 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 WDR27A2RRH5 827 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 DPYSL3Q14195 570 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 GRK2P25098 689 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 HDAC4P56524 1084 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KAT2BQ92831 832 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP10A1A4S6 786 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TPH1P17752 444 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MGAT1P26572 445 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SKOR1P84550 965 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 LRRC38Q5VT99 294 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RNF103O00237 685 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TOMM70O94826 608 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 YDJCA8MPS7 323 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ALDH2P05091 517 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NOMO3P69849 1222 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 POU6F1Q14863 301 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAM84AQ96KN4 292 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SERPINB5P36952 375 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 STX5Q13190 355 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FLOT2Q14254 428 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KLRG1Q96E93 195 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GAD1Q99259 594 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MAGEB16A2A368 324 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CCNE2O96020 404 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CDH17Q12864 832 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NPY5RQ15761 445 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 UNC93AQ86WB7 457 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAM136AQ96C01 138 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HES2Q9Y543 173 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HEATR9A2RTY3 570 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ETS1P14921 441 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TMED1Q13445 227 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RASA2Q15283 850 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GALNT4Q8N4A0 578 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TEX9Q8N6V9 391 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RNF112Q9ULX5 631 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NRCAMQ92823 1304 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MTFR1Q15390 333 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SENP8Q96LD8 212 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CD248Q9HCU0 757 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 VPS26AO75436 327 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GP5P40197 560 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MARC1Q5VT66 337 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms