RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR59Q6PJI9 974 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MDM1Q8TC05 714 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 RICTORQ6R327 1708 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR23AA6NEV1 266 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM66O15016 1216 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CHADLQ6NUI6 762 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 VAT1Q99536 393 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 L1RE1Q9UN81 338 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 UROC1Q96N76 676 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD17B14Q9BPX1 270 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 HACD1B0YJ81 288 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH1A2O94788 518 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 GRK2P25098 689 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 HPCAP84074 193 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CNGA2Q16280 664 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 EME1Q96AY2 570 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 IL17RAQ96F46 866 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 GPAMQ9HCL2 828 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 E5RJQ4 531 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 COPAP53621 1224 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 OLFM3Q96PB7 478 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT8Q9BYC5 575 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TISP43B9A030 160 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MIPP30301 263 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP5P51878 434 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 RAP1GDS1P52306 607 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF333Q96JL9 665 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 AP5Z1O43299 807 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SCNN1GP51170 649 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 HSFY1Q96LI6 401 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 PYGMP11217 842 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 BDNFP23560 247 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPSQ13938 189 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 IL31RAQ8NI17 732 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CAVIN3Q969G5 261 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TLR10Q9BXR5 811 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CDT1Q9H211 546 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 GANQ9H2C0 597 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB18Q96M61 343 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 AMPD1P23109 780 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP2C18P33260 490 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 NOS2P35228 1153 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM162AQ96A26 154 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 TSC22D3Q99576 134 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 UBP1Q9NZI7 540 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 C2CD2Q9Y426 696 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 KLRC4O43908 158 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ARIH2O95376 493 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 APOC2P02655 101 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK1P28482 360 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 STARD3Q14849 445 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms