RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TIFABQ6ZNK6 161 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 GMLQ99445 158 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CNPY3Q9BT09 278 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 OGTO15294 1046 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ITM2AO43736 263 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RAD17O75943 681 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CNTFP26441 200 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SERPINB6P35237 376 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 GRIA2P42262 883 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TRIP10Q15642 601 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ATG4CQ96DT6 458 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 WNK4Q96J92 1243 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 NDUFA13Q9P0J0 144 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PRPSAP2O60256 369 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 GSRP00390 522 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 TGM2P21980 687 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEA3P43357 314 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 CHN2P52757 468 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 BCAR1P56945 870 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PDK3Q15120 406 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ILDR2Q71H61 639 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SPATA24Q86W54 205 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 MMP19Q99542 508 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 APOL1O14791 398 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 TNNC2P02585 160 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 HOXC6P09630 235 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 MYL4P12829 197 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 GPD1P21695 349 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ORC1Q13415 861 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 MAP7Q14244 749 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PPP4R1Q8TF05 950 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 BTBD9Q96Q07 612 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ATXN10Q9UBB4 475 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 POMPQ9Y244 141 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 A6NJR5 290 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 MSCO60682 206 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 RAG1P15918 1043 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 EFNA5P52803 228 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SATL1Q86VE3 508 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 EPB41L1Q9H4G0 881 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PSME4Q14997 1843 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PEX1O43933 1283 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 HMGCRP04035 888 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 VAV1P15498 845 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 CHRNA5P30532 468 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PDK2Q15119 407 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 C16orf46Q6P387 395 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 C4orf22Q6V702 233 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF534Q76KX8 674 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 HIPK4Q8NE63 616 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 USP6NLQ92738 828 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 NLRP4Q96MN2 994 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 TXNDC9O14530 226 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 GLRA3O75311 464 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 MICAL2O94851 1124 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SERPINE1P05121 402 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 PDGFRAP16234 1089 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 KCNA4P22459 653 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 IDH3AP50213 366 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRC25-201ENST00000339007 SP2Q02086 613 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms