RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CEACAM1P13688 526 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 ENGP17813 658 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 MAPK8P45983 427 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 RAD23BP54727 409 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 COG7P83436 770 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 EFEMP1Q12805 493 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 TATDN2Q93075 761 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 P2RY11Q96G91 374 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO10Q9UK96 956 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 RAD54BQ9Y620 910 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.6■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF217O75362 1048 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CFIP05156 583 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 HMBSP08397 361 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 HOXD12P35452 270 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CHKAP35790 457 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF33AQ06730 810 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 PIGZQ86VD9 579 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 WASH3PC4AMC7 463 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 GFRA2O00451 464 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 PNOCQ13519 176 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 RAB41Q5JT25 222 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 DCLK3Q9C098 648 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.58■□□□□ 0.89
CXCL3-201ENST00000296026 PRCPP42785 496 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SLC8A3P57103 927 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FOXC1Q12948 553 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CBWD6Q4V339 395 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FYB2Q5VWT5 728 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB124Q8NES8 71 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CEP76Q8TAP6 659 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 RMND1Q9NWS8 449 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.57■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SERPINF2P08697 491 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TKTL1P51854 596 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 MFAP3P55082 362 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 DENND1CQ8IV53 801 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TSG101Q99816 390 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CD93Q9NPY3 652 aa20.56■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SLC12A8A0AV02 714 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TULP2O00295 520 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ZBED1O96006 694 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 GEN1Q17RS7 908 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SLC32A1Q9H598 525 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CAPN10Q9HC96 672 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.55■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 NDUFS2O75306 463 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CYBBP04839 570 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PDE4CQ08493 712 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CUL2Q13617 745 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 STARD3Q14849 445 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SGO2Q562F6 1265 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms