RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 NRBF2Q96F24 287 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 A0A0U1RQJ8 604 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 LONP2Q86WA8 852 aa21.88■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 BTBD19C9JJ37 291 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 CRTAMO95727 393 aa21.88■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 PTK2BQ14289 1009 aa21.88■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 SRLQ86TD4 932 aa21.87■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.092e-7■■■■□ 22.5
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LRP5-201ENST00000294304 CDH17Q12864 832 aa21.86■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 SERPINF2P08697 491 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 MAGEB18Q96M61 343 aa21.86■■□□□ 1.09
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LRP5-201ENST00000294304 KRT34O76011 436 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 THTPAQ9BU02 230 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 MAF1Q9H063 256 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
LRP5-201ENST00000294304 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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