RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-201ENST00000253024 ENO4A6NNW6 628 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 CAPN9O14815 690 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 HBP1O60381 514 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 RASSF2P50749 326 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 NME8Q8N427 588 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 CXorf38Q8TB03 319 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 VPS11Q9H270 941 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 I3L4J1 428 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TM9SF1O15321 606 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GSC2O15499 205 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 SAT1P21673 171 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NEK3P51956 506 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 AP1B1Q10567 949 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NME3Q13232 169 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 UCMAQ8WVF2 138 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NSL1Q96IY1 281 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 APOL2Q9BQE5 337 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GJD2Q9UKL4 321 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 CLDN5O00501 218 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 BAG2O95816 211 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 CDK16Q00536 496 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 E2F7Q96AV8 911 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 THTPAQ9BU02 230 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PSAT1Q9Y617 370 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 A6NJR5 290 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 KCNK1O00180 336 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 ZMPSTE24O75844 475 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 KRT37O76014 449 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 ARMCX2Q7L311 632 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 AZIN2Q96A70 460 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 OSMRQ99650 979 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PAK5Q9P286 719 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 HESX1Q9UBX0 185 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 ITM2AO43736 263 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 USP1O94782 785 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 IL18RAPO95256 599 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TTC1Q99614 292 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 P4HA1P13674 534 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PGM1P36871 562 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TTLL4Q14679 1199 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 HMX2A2RU54 273 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 MAP3K13O43283 966 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC22O60826 627 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 RFPL1O75677 317 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GCKP35557 465 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 MLH1P40692 756 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 RBP5P82980 135 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GRM1Q13255 1194 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PARP6Q2NL67 630 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NRG4Q8WWG1 115 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 ATP5HO75947 161 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 GNAZP19086 355 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 INPP5DQ92835 1189 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TSPAN1O60635 241 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 KRT34O76011 436 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 APOEP02649 317 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 ARHGAP8P85298 464 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TAZQ16635 292 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 TBX10O75333 385 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 ERVK-10P10266 1014 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 MGAT1P26572 445 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 NDUFV1P49821 464 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM28-201ENST00000253024 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.04■■□□□ 1.12
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