RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CEP83Q9Y592 693 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-27P01718 113 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 GLI1P08151 1106 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FERP16591 822 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A3Q01959 620 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TMEM196Q5HYL7 178 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ERICH1Q86X53 443 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 XYLT1Q86Y38 959 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-25P01717 112 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 MESP2Q0VG99 397 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 NR1H3Q13133 447 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CCINQ13939 588 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 C12orf40Q86WS4 652 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA1Q92805 767 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 PLD4Q96BZ4 506 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 C18orf8Q96DM3 657 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 AGPAT1Q99943 283 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 AP5Z1O43299 807 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GRAP2O75791 330 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 COL9A1P20849 921 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 MMP8P22894 467 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A11P48066 632 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 PTP4A2Q12974 167 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GAS6Q14393 721 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TAC4Q86UU9 113 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 DENND1CQ8IV53 801 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 DEFB106AQ8N104 65 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 DTWD2Q8NBA8 298 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ADAM32Q8TC27 787 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A13Q96H72 371 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 DCLK3Q9C098 648 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQJ5 194 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GFRA2O00451 464 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 PRSS33Q8NF86 280 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 NUP58Q9BVL2 599 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 MARK1Q9P0L2 795 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ATG2BQ96BY7 2078 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 HSF2BPO75031 334 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ADH5P11766 374 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 PRKCIP41743 596 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 NUBP1P53384 320 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SNX16P57768 344 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 AMPD2Q01433 879 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CENPCQ03188 943 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CD101Q93033 1021 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 RBSNQ9H1K0 784 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SYNCQ9H7C4 482 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ITIH6Q6UXX5 1313 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ANTXRLA6NF34 631 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 NCAM2O15394 837 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ADH1CP00326 375 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 EGFP01133 1207 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 GYPCP04921 128 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SCNN1AP37088 669 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TBX4P57082 545 aa23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms