RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP4P49662 377 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 COL28A1Q2UY09 1125 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZD3Q86UT5 571 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A14Q8TDB8 520 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PLK2Q9NYY3 685 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MARK1Q9P0L2 795 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE4BO95155 1302 aa28.89■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GTW7 788 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GFRA2O00451 464 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPNS1P04632 268 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAM1P13591 858 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 STK38Q15208 465 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMIZ2Q8NF64 920 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR174Q9BXC1 333 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM49BQ9NUQ9 324 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD4Q9NVX7 518 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GREM1O60565 184 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 BEST1O76090 585 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOA4Q13772 614 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SDCBP2Q9H190 292 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CUEDC2Q9H467 287 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 STON1Q9Y6Q2 735 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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CAPNS1-217ENST00000629983 P4HA1P13674 534 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT1P21579 422 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ADORA2BP29275 332 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MDM1Q8TC05 714 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 VRTNQ9H8Y1 702 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP26A1O43174 497 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT11Q495W5 492 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CISD3P0C7P0 127 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM200BP0CF97 657 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NDST1P52848 882 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL4AQ13619 759 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F4Q16254 413 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf120Q5SQS8 335 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHO2Q8TD55 490 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GAREM1Q9H706 876 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 IL21RQ9HBE5 538 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CYLDQ9NQC7 956 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGXB4Q9UGU5 601 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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CAPNS1-217ENST00000629983 RARGP13631 454 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MATKP42679 507 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 AP3M2P53677 418 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF12L1Q5VU92 463 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa28.83■■■□□ 2.21
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CAPNS1-217ENST00000629983 CACUL1Q86Y37 369 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 IQUBQ8NA54 791 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 OSER1Q9NX31 292 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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CAPNS1-217ENST00000629983 SCML2Q9UQR0 700 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 RAXQ9Y2V3 346 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQH9 124 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G4AP47712 749 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC13DQ70J99 1090 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf29Q8N999 325 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 UCMAQ8WVF2 138 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DNASE2BQ8WZ79 361 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP192Q8TEP8 1941 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8CPA6NN73 597 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CBFA2T3O75081 653 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ACADMP11310 421 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GLRX5Q86SX6 157 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf56Q8IXR9 622 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CADM4Q8NFZ8 388 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SIPA1Q96FS4 1042 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf25Q9BPX7 421 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 BLZF1Q9H2G9 400 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NMUR1Q9HB89 426 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ITM2CQ9NQX7 267 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TM7SF3Q9NS93 570 aa28.81■■■□□ 2.2
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