RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628883.2

PCBP1-AS1-335, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 891 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCNX2A6NKB5 2137 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 A0A1W2PQF6 199 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TBC1D3BA6NDS4 549 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IKBKBO14920 756 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CYP26A1O43174 497 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CACNG3O60359 315 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TBX18O95935 607 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HLA-DRAP01903 254 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM200BP0CF97 657 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PFKFB1P16118 471 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GABRG2P18507 467 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PIK3CAP42336 1068 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NFIL3Q16649 462 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 C10orf76Q5T2E6 689 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SYT12Q8IV01 421 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PIGKQ92643 395 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PNPLA8Q9NP80 782 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MARK1Q9P0L2 795 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CFAP45Q9UL16 551 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HPSEQ9Y251 543 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MAPK13O15264 365 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CLSTN1O94985 981 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MYL1P05976 194 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CEACAM1P13688 526 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CMA1P23946 247 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NTSR1P30989 418 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HOXD12P35452 270 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LMAN2Q12907 356 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ANO4Q32M45 955 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LYSMD4Q5XG99 296 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CEP135Q66GS9 1140 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SLC23A3Q6PIS1 610 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 Q6ZNB5 142 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HSCBQ8IWL3 235 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 P2RY11Q96G91 374 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NACA2Q9H009 215 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NMUR1Q9HB89 426 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 USP25Q9UHP3 1055 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PILRBQ9UKJ0 227 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CKAP5Q14008 2032 aa10.77□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 A0A1B0GVL5 298 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 A0A1W2PQH9 124 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PRRT4C9JH25 899 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CILPO75339 1184 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RHOBTB3O94955 611 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PROS1P07225 676 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIM49P0CI25 452 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIM49CP0CI26 452 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HOXB2P14652 356 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TYRP14679 529 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ENGP17813 658 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ITPKAP23677 461 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ADORA2BP29275 332 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DPP6P42658 865 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 VAMP7P51809 220 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ENPEPQ07075 957 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PPP3CAQ08209 521 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GRAMD4Q6IC98 578 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KIAA1211LQ6NV74 962 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SCD5Q86SK9 330 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PIP4P1Q86T03 277 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TAS1R2Q8TE23 839 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CYFIP2Q96F07 1278 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ACOX2Q99424 681 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GABRG3Q99928 467 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BBS2Q9BXC9 721 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms