RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.91□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 EMC1Q8N766 993 aa8.91□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.91□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 ITFG1Q8TB96 612 aa8.91□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 ING5Q8WYH8 240 aa8.91□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.91□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 TRNP1Q6NT89 227 aa8.9□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.9□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.9□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 SULT1E1P49888 294 aa8.89□□□□□ -0.99
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SGMS1-211ENST00000626236 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-211ENST00000626236 ATP11AP98196 1134 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-211ENST00000626236 EFEMP1Q12805 493 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-211ENST00000626236 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-211ENST00000626236 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-211ENST00000626236 CDO1Q16878 200 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-211ENST00000626236 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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