RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613488.2

CU639417.2-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CU639417.2, Length 4,705 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.2-201ENST00000613488 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 MMRN1Q13201 1228 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CSHL1Q14406 222 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 RICTORQ6R327 1708 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 RHOBTB1O94844 696 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 THRAP10827 490 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 FUT11Q495W5 492 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 REPS2Q8NFH8 660 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 DNERQ8NFT8 737 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 COPS5Q92905 334 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 APOL5Q9BWW9 433 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ACOT9Q9Y305 439 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.98■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ZACNQ401N2 412 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ERO1BQ86YB8 467 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 NETO2Q8NC67 525 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CERKQ8TCT0 537 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CEP19Q96LK0 163 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ENTPD5O75356 428 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SNHG28P0DPA3 235 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 LINC00523Q86TU6 105 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CCNJLQ8IV13 435 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 MRC1P22897 1456 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 DCXO43602 365 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 NFKBIAP25963 317 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 INPP5DQ92835 1189 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 HIC2Q96JB3 615 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 MUC3BQ9H195 1237 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 FSCN2O14926 492 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ENDOD1O94919 500 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TGFB3P10600 412 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SLC1A6P48664 564 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 NOMO3P69849 1222 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CENPTQ96BT3 561 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PHF21BQ96EK2 531 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PKP3Q9Y446 797 aa15.97■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 F8W8V4 182 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 GRK2P25098 689 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 DAB2P98082 770 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TBCCQ15814 346 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 DEFB106AQ8N104 65 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 SH3GL2Q99962 352 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 FICDQ9BVA6 458 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 HES2Q9Y543 173 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 RNF103O00237 685 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TSPAN3O60637 253 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PAX7P23759 505 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TM4SF1P30408 202 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ATICP31939 592 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 STX5Q13190 355 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 A0A1W2PPM1 405 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 RGL2O15211 777 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 CATSPER2Q96P56 530 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 PTPRHQ9HD43 1115 aa15.96■□□□□ 0.15
CU639417.2-201ENST00000613488 NFICP08651 508 aa15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 SPDYCQ5MJ68 293 aa15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 STK32AQ8WU08 396 aa15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.96■□□□□ 0.14
CU639417.2-201ENST00000613488 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms