RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CHADO15335 359 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 OR4Q2P0C623 313 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ATF2P15336 505 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 FECHP22830 423 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SOX9P48436 509 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC8A3P57103 927 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP27A1Q02318 531 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 HGSNATQ68CP4 663 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM35AQ86V20 835 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TFAP2BQ92481 460 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 MED10Q9BTT4 135 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP83Q9Y592 693 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF4O00268 1085 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 MOSPD3O75425 235 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM200BP0CF97 657 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SETSIPP0DME0 302 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC130P13994 396 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 BCAT1P54687 386 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CCINQ13939 588 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 YAF2Q8IY57 180 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 AGPAT1Q99943 283 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 EDEM2Q9BV94 578 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 LHX5Q9H2C1 402 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP4F11Q9HBI6 524 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 NCANO14594 1321 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf47A7E2U8 309 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CTHP32929 405 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TUFMP49411 452 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL6Q6IPX3 200 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR59Q6PJI9 974 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ELMOD1Q8N336 334 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 LEMD2Q8NC56 503 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL3Q969E4 200 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT11Q9BT88 431 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP16Q9BY84 665 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ACP6Q9NPH0 428 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ITPR1Q14643 2758 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 NRDCO43847 1150 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CEACAM1P13688 526 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT82Q9NSB4 513 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 INSL5Q9Y5Q6 135 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 M0QYV0 167 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM66O15016 1216 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC24AO95486 1093 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ADORA2BP29275 332 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHA5P54756 1037 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 FMO1Q01740 532 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PLD1Q13393 1074 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PKDCCQ504Y2 493 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 C8orf48Q96LL4 319 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 NOX5Q96PH1 765 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 AP1G2O75843 785 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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