RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591962.1

AC005954.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC005954.1, Length 337 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005954.1-201ENST00000591962 LINC01465Q8N7H1 131 aa9□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 RNF149Q8NC42 400 aa9□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TRIM8Q9BZR9 551 aa9□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MYO6Q9UM54 1294 aa9□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ZNF233A6NK53 670 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ACKR2O00590 384 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 EPHB6O15197 1021 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MSCO60682 206 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 OFD1O75665 1012 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TOM1L1O75674 476 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PRAMEF1O95521 474 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PRKCBP05771 671 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CCDC175P0C221 793 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CYBAP13498 195 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PON1P27169 355 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 HOXD10P28358 340 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GTF2H1P32780 548 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ECI1P42126 302 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CTSKP43235 329 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 FLT3LGP49771 235 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CLCN3P51790 818 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PTENP60484 403 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ERVFRD-1P60508 538 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MYL7Q01449 175 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CYP24A1Q07973 514 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MAPK6Q16659 721 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PDXDC1Q6P996 788 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 WDR59Q6PJI9 974 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MZB1Q8WU39 189 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MAP7D2Q96T17 732 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GANQ9H2C0 597 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 FZD8Q9H461 694 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 IFT22Q9H7X7 185 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CHST7Q9NS84 486 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GCNT4Q9P109 453 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GABRQQ9UN88 632 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 NRCAMQ92823 1304 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.99□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 A0A0B4J269 797 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 LRRC53A6NM62 1247 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 USP27XA6NNY8 438 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ARVCFO00192 962 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 HAS3O00219 553 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ARNTLO00327 626 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 NEMP1O14524 444 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ZEB2O60315 1214 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TBC1D8O95759 1140 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ADRB2P07550 413 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TRIM49P0CI25 452 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TRIM49CP0CI26 452 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 UCHL3P15374 230 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 SLC9A1P19634 815 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 CDR1P51861 262 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 GJA9P57773 515 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 NKX3-2P78367 333 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 PRKCZQ05513 592 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 FAM187BQ17R55 369 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 RRAGAQ7L523 313 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ZNF410Q86VK4 478 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 FAM129CQ86XR2 697 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 TRPV1Q8NER1 839 aa8.98□□□□□ -0.97
AC005954.1-201ENST00000591962 FRS2Q8WU20 508 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms