RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 CXCL14O95715 111 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 CA8P35219 290 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 ARSEP51690 589 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 COPS2P61201 443 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 CA9Q16790 459 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 KAZNQ674X7 775 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 TMC7Q7Z402 723 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 MON1AQ86VX9 555 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 TEKT4Q8WW24 435 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 RRN3Q9NYV6 651 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 MDM4O15151 490 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 CETN2P41208 172 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 GMIPQ9P107 970 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.53■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 DNAJB1P25685 340 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 PTPN7P35236 360 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 CDH6P55285 790 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 TAF10Q12962 218 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 TAZQ16635 292 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 FBXO32Q969P5 355 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 DDIT4Q9NX09 232 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 LZTS1Q9Y250 596 aa20.52■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 CSPG5O95196 566 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TAC4Q86UU9 113 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 POF1BQ8WVV4 589 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TCF25Q9BQ70 676 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 COMMD8Q9NX08 183 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 CA3P07451 260 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 SPATA31D3P0C874 917 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 IL4RP24394 825 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 CREMQ03060 361 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 MMRN1Q13201 1228 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 DPYSL3Q14195 570 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 PPP2R5EQ16537 467 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 HINFPQ9BQA5 517 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 CALN1Q9BXU9 219 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.875e-7■■■□□ 18.5
PGS1-211ENST00000589425 FZD10Q9ULW2 581 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.51■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 L1CAMP32004 1257 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 SLC7A5Q01650 507 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 C8orf74Q6P047 294 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 CASP10Q92851 521 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 AMACRQ9UHK6 382 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 YIPF1Q9Y548 306 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 PLXNA3P51805 1871 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.5■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 I6L893 689 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 DYNC1I1O14576 645 aa20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 RAD51CO43502 376 aa20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TGM5O43548 720 aa20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 PHF2O75151 1096 aa20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 TJP3O95049 919 aa20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 F9P00740 461 aa20.49■□□□□ 0.87
PGS1-211ENST00000589425 IGLV3-25P01717 112 aa20.49■□□□□ 0.87
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