RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 ERMARDQ5T6L9 678 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MON1AQ86VX9 555 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM131BQ86XD5 332 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC185Q8N715 623 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 KCTD6Q8NC69 237 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAM32Q8TC27 787 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 COMMD8Q9NX08 183 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 OSER1Q9NX31 292 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PQH9 124 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF15O94989 841 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 YWHAQP27348 245 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CTNNB1P35222 781 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CREMQ03060 361 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 DEUP1Q05D60 604 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CA9Q16790 459 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM71BQ8TC56 605 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 LZTS1Q9Y250 596 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 EFR3BQ9Y2G0 817 aa27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MAIP1Q8WWC4 291 aa27.11■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TTLL2Q9BWV7 592 aa27.11■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.11■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF2O75151 1096 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 IGLV3-25P01717 112 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CDH6P55285 790 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 NME3Q13232 169 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 DPYSL3Q14195 570 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SHHQ15465 462 aa27.1■■□□□ 1.93
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SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD8Q5XKL5 378 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 C8orf74Q6P047 294 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRED2Q7Z698 418 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TAC4Q86UU9 113 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 GIPC2Q8TF65 315 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 HDAC7Q8WUI4 952 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 PNKPQ96T60 521 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 DDIT4Q9NX09 232 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 GMIPQ9P107 970 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 NR2E3Q9Y5X4 410 aa27.1■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC38A8A6NNN8 435 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MYOGP15173 224 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 DPYSL2Q16555 572 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP4F11Q9HBI6 524 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 COX16Q9P0S2 106 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 FZD10Q9ULW2 581 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 AP4E1Q9UPM8 1137 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 GRXCR1A8MXD5 290 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 IL4RP24394 825 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 PDK2Q15119 407 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 KAZNQ674X7 775 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP18Q8N392 663 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO32Q969P5 355 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM204AQ9H8W3 233 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 YIPF1Q9Y548 306 aa27.09■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 GBF1Q92538 1859 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 RAD51CO43502 376 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TJP3O95049 919 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 F9P00740 461 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 L1CAMP32004 1257 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TAF10Q12962 218 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC27Q6P3X3 843 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TMC7Q7Z402 723 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 VSIG1Q86XK7 387 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 TCEAL8Q8IYN2 117 aa27.08■■□□□ 1.93
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SCAMP4-210ENST00000588555 PARD6BQ9BYG5 372 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGEB5Q9BZ81 275 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SMOC2Q9H3U7 446 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC19Q9H756 370 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.931e-7■■■■□ 22.5
SCAMP4-210ENST00000588555 MAFFQ9ULX9 164 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 IRAK3Q9Y616 596 aa27.08■■□□□ 1.93
SCAMP4-210ENST00000588555 CHRNA3P32297 505 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CXCR3P49682 368 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ERVFC1P60507 584 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 SPPL3Q8TCT6 385 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 NTAN1Q96AB6 310 aa27.07■■□□□ 1.92
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