RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 DNAJC7Q99615 494 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 RNF38Q9H0F5 515 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 COCHO43405 550 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TLR5O60602 858 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 VIPR2P41587 438 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ARID5BQ14865 1188 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CNGA4Q8IV77 575 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 DRC7Q8IY82 874 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 C18orf8Q96DM3 657 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 PRAMEF12O95522 483 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 OLFM2O95897 454 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 LTFP02788 710 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CDC25BP30305 580 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 GABRB2P47870 512 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 PFKPQ01813 784 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CENPCQ03188 943 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 C2CD6Q53TS8 623 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 GOLGA1Q92805 767 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 NACA2Q9H009 215 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TDP1Q9NUW8 608 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CCL26Q9Y258 94 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 DPYSL4O14531 572 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TBX18O95935 607 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SP9P0CG40 484 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SLC7A9P82251 487 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 WDR59Q6PJI9 974 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF276Q8N554 614 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 EDEM1Q92611 657 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 E2F7Q96AV8 911 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CPQQ9Y646 472 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 COL4A2P08572 1712 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 29.4
SPHK1-204ENST00000587167 MDM4O15151 490 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 MMP8P22894 467 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SLC6A3Q01959 620 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 VITQ6UXI7 678 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 VPS36Q86VN1 386 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 XYLT1Q86Y38 959 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TC2NQ8N9U0 490 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 TTC16Q8NEE8 873 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 RNF139Q8WU17 664 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-204ENST00000587167 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms