RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 CYP24A1Q07973 514 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 ORC1Q13415 861 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 STARD3Q14849 445 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 PSMD6Q15008 389 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 DCAF12L1Q5VU92 463 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 PDILTQ8N807 584 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF516Q92618 1163 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 CRELD1Q96HD1 420 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 TM7SF3Q9NS93 570 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 TOR4AQ9NXH8 423 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 IL37Q9NZH6 218 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 MARK1Q9P0L2 795 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 WDR35Q9P2L0 1181 aa18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 BPTFQ12830 3046 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 KCNJ18B7U540 433 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 MDM4O15151 490 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 PHACTR2O75167 634 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BEST1O76090 585 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CER1O95813 267 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BNC1Q01954 994 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ACOT1Q86TX2 421 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FUKQ8N0W3 1084 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SMOQ99835 787 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM131Q92545 1883 aa18.51■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FAM92AA1XBS5 289 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GFRA2O00451 464 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CISD3P0C7P0 127 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CASP4P49662 377 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K7CLP57077 242 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CYP4F3Q08477 520 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 HLA-BQ31612 363 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC157Q569K6 752 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 P2RY11Q96G91 374 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TNIP3Q96KP6 325 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SDCBP2Q9H190 292 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 OSER1Q9NX31 292 aa18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FAM149AA5PLN7 773 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CYP26A1O43174 497 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TGFB1I1O43294 461 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ATICP31939 592 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 IL12RB1P42701 662 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TPMTP51580 245 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BIRC3Q13489 604 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF699Q32M78 642 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SNX19Q92543 992 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 COMMD8Q9NX08 183 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BTBD3Q9Y2F9 522 aa18.49■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1B0GVT2 93 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TRABD2BA6NFA1 517 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF883P0CG24 379 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GEN1Q17RS7 908 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 C8orf34Q49A92 452 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FAM124AQ86V42 546 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CADM4Q8NFZ8 388 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CYLDQ9NQC7 956 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa18.48■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 METTL12A8MUP2 240 aa18.47■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FLRT2O43155 660 aa18.47■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ADORA2BP29275 332 aa18.47■□□□□ 0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ASIC1P78348 528 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms