RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.23■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIOO75962 3097 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCAM2O15394 837 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PI15O43692 258 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNX16P57768 344 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HTR3DQ70Z44 454 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPXM1Q96SM3 734 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.22■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM170BA6NMN3 283 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAGEA9P43362 315 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NR1I3Q14994 352 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EDEM1Q92611 657 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WBP2Q969T9 261 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNH6Q9H252 994 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO6Q9UM54 1294 aa23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GREM1O60565 184 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STC2O76061 302 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP17A1P05093 508 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GJA4P35212 333 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF3Q5VWG9 929 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BEND5Q7L4P6 421 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOC4Q96A65 974 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRRX2Q99811 253 aa23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC12A8A0AV02 714 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADH1CP00326 375 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMEP08473 750 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBASH3AP57075 661 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF445P59923 1031 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDR2Q01850 454 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q6ZNB5 142 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLDN23Q96B33 292 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLD4Q96BZ4 506 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCLK3Q9C098 648 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.19■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F5P12259 2224 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC172P0C7W6 258 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL9A1P20849 921 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DHCR24Q15392 516 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHFRQ96EP1 664 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYNCQ9H7C4 482 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.18■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERBB2P04626 1255 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLI1P08151 1106 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCAM1P13591 858 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FERP16591 822 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOMO3P69849 1222 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC32Q14392 662 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PON2Q15165 354 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DTWD2Q8NBA8 298 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BAP1Q92560 729 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAPN9O14815 690 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMBSP08397 361 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADH5P11766 374 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMO1Q01740 532 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FZD5Q13467 585 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FIGNQ5HY92 759 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM196Q5HYL7 178 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms