RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.75□□□□□ -1.49
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CAPN3-211ENST00000562199 WDR64B1ANS9 1081 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 E7EVH7 732 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 H0YIN7 160 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2CO00762 179 aa5.74□□□□□ -1.49
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CAPN3-211ENST00000562199 BUB1O43683 1085 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 SLC25A17O43808 307 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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CAPN3-211ENST00000562199 PPM1BO75688 479 aa5.74□□□□□ -1.49
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CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 POU2F1P14859 743 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 CASTP20810 708 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 PDCP20941 246 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 ADSSP30520 456 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 CCR1P32246 355 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 LSP1P33241 339 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 BMI1P35226 326 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R2P41236 205 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 STAT5BP51692 787 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 THOP1P52888 689 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 TPM4P67936 248 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 ASIC1P78348 528 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 KCNJ10P78508 379 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPN3-211ENST00000562199 ABATP80404 500 aa5.74□□□□□ -1.49
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