RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 KLHL22Q53GT1 634 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 USP49Q70CQ1 688 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 APIPQ96GX9 242 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 KAZALD1Q96I82 304 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 MARK4Q96L34 752 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 CHST8Q9H2A9 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 COL20A1Q9P218 1284 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 FZD4Q9ULV1 537 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SMARCA4P51532 1647 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 AGPSO00116 658 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 FYB1O15117 783 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 MGEA5O60502 916 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 TULP3O75386 442 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 HRGP04196 525 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 MYF5P13349 255 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 IL1R1P14778 569 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 CCKARP32238 428 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 GPC5P78333 572 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 FMO1Q01740 532 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SLC14A1Q13336 389 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 MIDNQ504T8 468 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 RNF220Q5VTB9 566 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 PIM3Q86V86 326 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SKAP1Q86WV1 359 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 USP29Q9HBJ7 922 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 HEY2Q9UBP5 337 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 VPS51Q9UID3 782 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 ZNF580Q9UK33 172 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 COL15A1P39059 1388 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 GAPVD1Q14C86 1478 aa3.97□□□□□ -1.77
RRN3-204ENST00000561685 CLASP1Q7Z460 1538 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 CD8B2A6NJW9 211 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 GOLIM4O00461 696 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 INPPL1O15357 1258 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 SCGB1D2O95969 90 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 ZBED1O96006 694 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 TOMM40O96008 361 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 CD63P08962 238 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 TMEM225BP0DP42 221 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 COPAP53621 1224 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 YPEL5P62699 121 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 FAM193AP78312 1265 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 DEUP1Q05D60 604 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 PPP2R5AQ15172 486 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 NUAK2Q9H093 628 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 IFT140Q96RY7 1462 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 H3BNX3 289 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 PSG1P11464 419 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 THBS3P49746 956 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 JAK3P52333 1124 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 STIM1Q13586 685 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 MANEALQ5VSG8 457 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.95□□□□□ -1.78
RRN3-204ENST00000561685 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms