RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	YDJC	A8MPS7	323 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MYO1C	O00159	1063 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TOR1B	O14657	336 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	KPNA5	O15131	536 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-DOA	P06340	250 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CHML	P26374	656 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MXRA7	P84157	204 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FPGS	Q05932	587 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TUBA3C	Q13748	450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2A13	Q16696	494 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CNTROB	Q8N137	903 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	KRT78	Q8N1N4	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	POC1B	Q8TC44	478 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PSMD1	Q99460	953 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	EYA3	Q99504	573 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MXD3	Q9BW11	206 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	DPH1	Q9BZG8	443 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	COA1	Q9GZY4	146 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	IL25	Q9H293	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	COL20A1	Q9P218	1284 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	RAD54B	Q9Y620	910 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SNED1	Q8TER0	1413 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	NCAN	O14594	1321 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	LRP5	O75197	1615 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MED23	Q9ULK4	1368 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934		F8W8V4	182 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	DCLK1	O15075	740 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PPIP5K2	O43314	1243 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PRIM2	P49643	509 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TCF15	Q12870	199 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TP53BP2	Q13625	1128 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	DYRK1A	Q13627	763 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	LONRF1	Q17RB8	773 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MIIP	Q5JXC2	388 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MICU3	Q86XE3	530 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CERS5	Q8N5B7	392 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF384	Q8TF68	577 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	HAS1	Q92839	578 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	BOD1	Q96IK1	185 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FSD1	Q9BTV5	496 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	DKK2	Q9UBU2	259 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FZD1	Q9UP38	647 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SPEF2	Q9C093	1822 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WWL8	130 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0D9SFI3	127 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	ECE2	O60344	883 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	CDKL5	O76039	1030 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	SPDEF	O95238	335 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	GATA3	P23771	443 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	ADD2	P35612	726 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	BMPR1A	P36894	532 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LINS1-210	ENST00000560934	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58

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