RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.4□□□□□ -1.06
SMAD3-212ENST00000559937 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 KBTBD13C9JR72 458 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SPAG7O75391 227 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 DGKIO75912 1065 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 DCTN3O75935 186 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 ATP5HO75947 161 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FBXO21O94952 628 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 IL1BP01584 269 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 INHBAP08476 426 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FGFR1P11362 822 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 MLNP12872 115 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 PAX3P23760 479 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 PRKCHP24723 683 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 RBL1P28749 1068 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 ADORA2BP29275 332 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 ALDH3A1P30838 453 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FOXN2P32314 431 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 NOS2P35228 1153 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 ARL4AP40617 200 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 GAD2Q05329 585 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 BNIP1Q12981 228 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 RIPK1Q13546 671 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CA9Q16790 459 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 RAB6CQ53S08 254 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 LGSNQ5TDP6 509 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CGB2Q6NT52 195 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CYS1Q717R9 158 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CHSY1Q86X52 802 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FUKQ8N0W3 1084 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 VPS52Q8N1B4 723 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 C7orf31Q8N865 590 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 BANPQ8N9N5 519 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CCDC63Q8NA47 563 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 NT5C3BQ969T7 300 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 APOPT1Q96IL0 206 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SLC9A7Q96T83 725 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 APBA2Q99767 749 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 DUSP16Q9BY84 665 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 VPS11Q9H270 941 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 KLC4Q9NSK0 619 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FZD10Q9ULW2 581 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 HES2Q9Y543 173 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 IPPQ9Y573 584 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 RAD54BQ9Y620 910 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 USP3Q9Y6I4 520 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 A0A1W2PPM1 405 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 C9IYK1 514 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 H3BRJ5 948 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 M0QZ92 97 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 PIK3R2O00459 728 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 GABRDO14764 452 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 SPTLC1O15269 473 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 TREHO43280 583 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 MGRN1O60291 552 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 BANF1O75531 89 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 KRT37O76014 449 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 UBOX5O94941 541 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 MT-ND3P03897 115 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-212ENST00000559937 MYL3P08590 195 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms