RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557206.1

HIF1A-210, Transcript of hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene HIF1A, Length 767 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1A-210ENST00000557206 USP29Q9HBJ7 922 aa5.89□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.89□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.89□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.89□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 OR2W5A6NFC9 320 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CA12O43570 354 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 USP1O94782 785 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PBX1P40424 430 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 DIO1P49895 249 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PSG6Q00889 435 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 BLMHQ13867 455 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CSHL1Q14406 222 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SPARCL1Q14515 664 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PFKFB4Q16877 469 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ZACNQ401N2 412 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CCDC38Q502W7 563 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CCDC17Q96LX7 622 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 WDR24Q96S15 920 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 MMS19Q96T76 1030 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PSMD1Q99460 953 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.88□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 KAT6AQ92794 2004 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 AQP12BA6NM10 295 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 J3KTA2 159 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SMIM22K7EJ46 135 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ZNF213O14771 459 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SUV39H1O43463 412 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PPFIA2O75334 1257 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PROP1O75360 226 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 GCATO75600 419 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 NTSR2O95665 410 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 NPPBP16860 134 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 MCM5P33992 734 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 INHBEP58166 350 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 DEUP1Q05D60 604 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SEMA3BQ13214 749 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 FHL3Q13643 280 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 C4orf46Q504U0 113 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 FAM71BQ8TC56 605 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SNX18Q96RF0 628 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 LRFN1Q9P244 771 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 LGALS16A8MUM7 142 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 MMP8P22894 467 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 RENBPP51606 427 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 MTAPQ13126 283 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PTK2BQ14289 1009 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TMEM65Q6PI78 240 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.86□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 H7C1Q1 480 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 NPC1O15118 1278 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ASNA1O43681 348 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 MT-CO3P00414 261 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 C1RP00736 705 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 ANXA6P08133 673 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 AKT1P31749 480 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TRAPPC10P48553 1259 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 KCNJ12Q14500 433 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 KRT72Q14CN4 511 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 CCDC174Q6PII3 467 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-210ENST00000557206 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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