RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	AAAS	Q9NRG9	546 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	SPG21	Q9NZD8	308 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	STK39	Q9UEW8	545 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-227	ENST00000556736	LIAS	O43766	372 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	KCNJ1	P48048	391 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DDR2	Q16832	855 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DUPD1	Q68J44	220 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	FAM131B	Q86XD5	332 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC114	Q96M63	670 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	RNF157	Q96PX1	679 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM51	Q9NW97	253 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	SCML2	Q9UQR0	700 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	APOC2	P02655	101 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	NME3	Q13232	169 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF365	Q70YC5	407 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	HDX	Q7Z353	690 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC185	Q8N715	623 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	EDEM1	Q92611	657 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	BAD	Q92934	168 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	FZD10	Q9ULW2	581 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	NFU1	Q9UMS0	254 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DAPK3	O43293	454 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	L1CAM	P32004	1257 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	GLUD2	P49448	558 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DYNLT1	P63172	113 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DSG1	Q02413	1049 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	NNT	Q13423	1086 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	EFHC2	Q5JST6	749 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	MON1A	Q86VX9	555 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	FAF2	Q96CS3	445 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PIGV	Q9NUD9	493 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DDIT4	Q9NX09	232 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	GJB5	O95377	273 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ROR1	Q01973	937 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	KRT17	Q04695	432 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CA9	Q16790	459 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	CAVIN3	Q969G5	261 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	DPH5	Q9H2P9	285 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	COX16	Q9P0S2	106 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	APOL1	O14791	398 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	UROD	P06132	367 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ITGAV	P06756	1048 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MEG3-227	ENST00000556736	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62

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