RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 UBR7Q8N806 425 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TERB1Q8NA31 727 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 NT5C1BQ96P26 610 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 BBS2Q9BXC9 721 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 HESX1Q9UBX0 185 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 NUP205Q92621 2012 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 SGK1O00141 431 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DCLK1O15075 740 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 P4HA2O15460 535 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 STC2O76061 302 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ALDH1A2O94788 518 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 VDRP11473 427 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TKTL1P51854 596 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 STX17P56962 302 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PDE4CQ08493 712 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CETN1Q12798 172 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PAK1Q13153 545 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ELF2Q15723 593 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 EOGTQ5NDL2 527 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ANO7Q6IWH7 933 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 Q6ZNB5 142 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 RASSF3Q86WH2 238 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 MIB1Q86YT6 1006 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 MARK1Q9P0L2 795 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TULP2O00295 520 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 O00370 1275 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TRIM24O15164 1050 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CACNG3O60359 315 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 RHOBTB1O94844 696 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 GNA14O95837 355 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ZBED1O96006 694 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 HMBSP08397 361 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PAEPP09466 180 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TYRP14679 529 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 9.7
PCNX4-209ENST00000555569 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 COG7P83436 770 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 EFEMP1Q12805 493 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM270Q6UE05 265 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 LMO3Q8TAP4 145 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 UBA3Q8TBC4 463 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 NETO1Q8TDF5 533 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 RTKNQ9BST9 563 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DCLK3Q9C098 648 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ADAM23O75077 832 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 SETSIPP0DME0 302 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 GBP1P32455 592 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 UBE2HP62256 183 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ADIGQ0VDE8 80 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 KCNH2Q12809 1159 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC6Q16204 474 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 C11orf74Q86VG3 221 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 KAT5Q92993 513 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.48□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 INVSQ9Y283 1065 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms