RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SAAL1	Q96ER3	474 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SHD	Q96IW2	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	B3GALT6	Q96L58	329 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CDT1	Q9H211	546 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TNMD	Q9H2S6	317 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CUEDC2	Q9H467	287 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CLMP	Q9H6B4	373 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	EXOC1	Q9NV70	894 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	APC2	O95996	2303 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C4orf47	A7E2U8	309 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994		F8W810	466 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OGT	O15294	1046 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	B3GAT3	O94766	335 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CBX7	O95931	251 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KRT19	P08727	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CLTA	P09496	248 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CXCL8	P10145	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ARNT	P27540	789 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXC13	P31276	330 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCD1	P33897	745 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP2J2	P51589	502 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CLCNKB	P51801	687 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CDR1	P51861	262 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CASP5	P51878	434 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GTF2B	Q00403	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SCAP	Q12770	1279 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GRIK3	Q13003	919 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TUSC3	Q13454	348 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PNOC	Q13519	176 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GRM2	Q14416	872 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZPBP2	Q6X784	338 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CEP68	Q76N32	757 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF843	Q8N446	348 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DEFB124	Q8NES8	71 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	IGSF21	Q96ID5	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EDEM2	Q9BV94	578 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM206	Q9H813	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LZTS1	Q9Y250	596 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KALRN	O60229	2985 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1W2PQ27	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1W2PQ64	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1W2PQD8	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF233	A6NK53	670 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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