RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 TBC1D17Q9HA65 648 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 KCNK12Q9HB15 430 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 TMLHEQ9NVH6 421 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 WNT16Q9UBV4 365 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-218ENST00000550159 VWA8A3KMH1 1905 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 KRBA1A5PL33 1030 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NARSO43776 548 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RNF8O76064 485 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SEC24AO95486 1093 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 F9P00740 461 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CKMP06732 381 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 USP17L7P0C7H9 530 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC2A3P11169 496 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 KRT3P12035 628 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ABCB4P21439 1286 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 KCNA4P22459 653 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MMP8P22894 467 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 FSHRP23945 695 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GABRR2P28476 465 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC6A3Q01959 620 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TMEM110Q86TL2 294 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TTC30AQ86WT1 665 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SCML4Q8N228 414 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 E2F7Q96AV8 911 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SMOQ99835 787 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 LPIN3Q9BQK8 851 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CA14Q9ULX7 337 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NCANO14594 1321 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TSC2P49815 1807 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 E5RJQ4 531 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MYO1FO00160 1098 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 LTFP02788 710 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RHOP08100 348 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NCAM1P13591 858 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SDC4P31431 198 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CETN2P41208 172 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TUBP50607 506 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 COG7P83436 770 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TAF10Q12962 218 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PMF1Q6P1K2 205 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GPR149Q86SP6 731 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 YAF2Q8IY57 180 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MCOLN2Q8IZK6 566 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 C3orf20Q8ND61 904 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GPR152Q8TDT2 470 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ATRIPQ8WXE1 791 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 EXOC4Q96A65 974 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MYRFLQ96LU7 910 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ULBP1Q9BZM6 244 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 FAM204AQ9H8W3 233 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ACP6Q9NPH0 428 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GDE1Q9NZC3 331 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MYO1AQ9UBC5 1043 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SPEGQ15772 3267 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 A0A087X0T9 212 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms