RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548313.5

DEPDC4-205, Transcript of DEP domain containing 4, human

TSL 3

Gene DEPDC4, Length 389 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DEPDC4-205	ENST00000548313	AOX1	Q06278	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PDE8B	O95263	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	NTSR2	O95665	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MCM5	P33992	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	DIO1	P49895	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	LMAN2	Q12907	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MUL1	Q969V5	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313		A0A087WV62	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	EXOC3	O60645	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MT-CO3	P00414	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	FPR3	P25089	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CFHR3	Q02985	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313		H3BNC9	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MMP8	P22894	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CD38	P28907	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PBX1	P40424	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	RENBP	P51606	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PRKCG	P05129	697 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	NPPB	P16860	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	GSTM5	P46439	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	POLE2	P56282	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TUBA4A	P68366	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ICA1	Q05084	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DEPDC4-205	ENST00000548313	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DEPDC4-205	ENST00000548313	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DEPDC4-205	ENST00000548313	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DEPDC4-205	ENST00000548313		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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