RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT82Q9NSB4 513 aa20.35■□□□□ 0.85
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CD27-AS1-208ENST00000538616 HDCP19113 662 aa20.31■□□□□ 0.84
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CD27-AS1-208ENST00000538616 EHD2Q9NZN4 543 aa20.31■□□□□ 0.84
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CD27-AS1-208ENST00000538616 TCF3P15923 654 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM193AP78312 1265 aa20.3■□□□□ 0.84
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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CD27-AS1-208ENST00000538616 FBXO32Q969P5 355 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF38Q9H0F5 515 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITPKAP23677 461 aa20.29■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 OPRD1P41143 372 aa20.29■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE6CP51160 858 aa20.29■□□□□ 0.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAD23BP54727 409 aa20.29■□□□□ 0.84
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