RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	HSD3B1	P14060	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DGKE	P52429	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ALF	Q53S48	1182 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NSD2	O96028	1365 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		A0A087WZ62	844 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0B4J269	797 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	FCHO1	O14526	889 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ASNA1	O43681	348 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SNX2	O60749	519 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	FAM20B	O75063	409 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	EGR1	P18146	543 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINF1	P36955	418 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	MTHFS	P49914	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CXADR	P78310	365 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GPS1	Q13098	491 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	REST	Q13127	1097 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TUBB3	Q13509	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	POSTN	Q15063	836 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TAF5	Q15542	800 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NPY5R	Q15761	445 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TAF12	Q16514	161 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ICE2	Q659A1	982 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		Q6ZSN1	163 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	IP6K1	Q92551	441 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NELL2	Q99435	816 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GPR20	Q99678	358 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GDF15	Q99988	308 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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