RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 EDEM1Q92611 657 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NPY6RQ99463 290 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM7Q9C029 511 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM10Q9UDY6 481 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 IP6K2Q9UHH9 426 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 STAP1Q9ULZ2 295 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PRU2 124 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 OLFM2O95897 454 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ABL1P00519 1130 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 GPD1P21695 349 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 SDC4P31431 198 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 BNIPLQ7Z465 357 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF139Q8WU17 664 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ENDOD1O94919 500 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV3-25P01717 112 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NTHL1P78549 312 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 OGDHQ02218 1023 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC14Q49A88 953 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 MAN1A1P33908 653 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NNTQ13423 1086 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 COCHO43405 550 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 DESP17661 470 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 MTHFRP42898 656 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 STRADAQ7RTN6 431 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TASP1Q9H6P5 420 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 OBSL1O75147 1896 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf78A6NCI8 922 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 PROSCO94903 275 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 F9P00740 461 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMA2P25787 234 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP4F8P98187 520 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 TXNDC8Q6A555 127 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 SUSD6Q92537 303 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 SERPINB11Q96P15 392 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 APOL5Q9BWW9 433 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 CD207Q9UJ71 328 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-205ENST00000528462 USP27XA6NNY8 438 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 BUB1O43683 1085 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TBX18O95935 607 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 FSHRP23945 695 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 WEE1P30291 646 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ITFG1Q8TB96 612 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF38Q9H0F5 515 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 GJA1P17302 382 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 HDCP19113 662 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC1A1P43005 524 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC7A9P82251 487 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TEAD2Q15562 447 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.94■■□□□ 1.26
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