RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521220.1

CCDC25-208, Transcript of coiled-coil domain containing 25, human

TSL 2

Gene CCDC25, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220		A0A088AWK7	358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ALDH2	P05091	517 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	YPEL5	P62699	121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	STIM1	Q13586	685 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RAB32	Q13637	225 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	INPPL1	O15357	1258 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CCP110	O43303	1012 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CD63	P08962	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	FGF2	P09038	288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	UQCRC1	P31930	480 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CPA2	P48052	419 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CTBP1	Q13363	440 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	INSC	Q1MX18	579 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MEIS3	Q99687	375 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220		A8MVJ9	347 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CLIC1	O00299	241 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	BTN3A1	O00481	513 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC28A2	O43868	658 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	USP12	O75317	370 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	NPR1	P16066	1061 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CDC25A	P30304	524 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MAGEA8	P43361	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PGGT1B	P53609	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220		A0A1W2PPL8	197 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	AKAP10	O43572	662 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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