RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514495.1

CTBP1-214, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-214	ENST00000514495	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	SGO2	Q562F6	1265 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	EOGT	Q5NDL2	527 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	RASSF3	Q86WH2	238 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	NELFB	Q8WX92	580 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	HESX1	Q9UBX0	185 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	RHOBTB1	O94844	696 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	EFEMP1	Q12805	493 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TERB1	Q8NA31	727 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	BICDL2	A1A5D9	508 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TRIM24	O15164	1050 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	GDF9	O60383	454 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TYR	P14679	529 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24	2e-7	■■■■■ 27.2
CTBP1-214	ENST00000514495	BMP6	P22004	513 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TKTL1	P51854	596 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	BCAT1	P54687	386 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	RAB41	Q5JT25	222 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TTI2	Q6NXR4	508 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	ZNF276	Q8N554	614 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	NT5C1B	Q96P26	610 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24	8e-6	■□□□□ 10.9
CTBP1-214	ENST00000514495	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	STC2	O76061	302 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	HMBS	P08397	361 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	MPL	P40238	635 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	29.03	■■■□□ 2.24	2e-6	■■■■□ 24.2
CTBP1-214	ENST00000514495	PDE4C	Q08493	712 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	MORC3	Q14149	939 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495		Q6ZNB5	142 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	BHMT	Q93088	406 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	MARK1	Q9P0L2	795 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TULP2	O00295	520 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	CACNG3	O60359	315 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	VDR	P11473	427 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	STX17	P56962	302 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	COG7	P83436	770 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	CETN1	Q12798	172 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	C11orf74	Q86VG3	221 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	UBR7	Q8N806	425 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-214	ENST00000514495	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	ADAM23	O75077	832 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	ZBED1	O96006	694 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	ZNF806	P0C7X5	589 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	CREB5	Q02930	508 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	TMEM270	Q6UE05	265 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	UBA3	Q8TBC4	463 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	SLC30A4	O14863	429 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PAK1	Q13153	545 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PGBD3	Q8N328	593 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	HMGB4	Q8WW32	186 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PLK2	Q9NYY3	685 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PMM2	O15305	246 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	WAS	P42768	502 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	DGKG	P49619	791 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	ADIG	Q0VDE8	80 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	DCLK3	Q9C098	648 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-214	ENST00000514495	VPS45	Q9NRW7	570 aa		28.99	■■■□□ 2.23

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