RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GIPC1O14908 333 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CACNG3O60359 315 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 HOXB2P14652 356 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 GABRG2P18507 467 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 NTSR1P30989 418 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G4AP47712 749 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 ST3GAL2Q16842 350 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ZCWPW2Q504Y3 356 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 C10orf120Q5SQS8 335 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 KRT39Q6A163 491 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC10Q6PID8 442 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SEMA4DQ92854 862 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ACOX2Q99424 681 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 DUSP16Q9BY84 665 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TMEM74BQ9NUR3 256 aa17.82■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 TRIM61Q5EBN2 209 aa17.81■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa17.81■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 SCD5Q86SK9 330 aa17.81■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SYT12Q8IV01 421 aa17.81■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 EEF2KMTQ96G04 330 aa17.81■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 SHC2P98077 582 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SPDYCQ5MJ68 293 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 LYSMD4Q5XG99 296 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SDE2Q6IQ49 451 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZNB5 142 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 DEFB119Q8N690 84 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 BHMTQ93088 406 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ERLEC1Q96DZ1 483 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PLK2Q9NYY3 685 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa17.8■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 EPG5Q9HCE0 2579 aa17.8■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 EDRF1Q3B7T1 1238 aa17.79■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ZNF276Q8N554 614 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 FBXL13Q8NEE6 735 aa17.79■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 P2RY11Q96G91 374 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 RAB20Q9NX57 234 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PILRBQ9UKJ0 227 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa17.79■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 LAMA1P25391 3075 aa17.78■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 EFEMP1Q12805 493 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 LMAN2Q12907 356 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TTC39CQ8N584 583 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SLC4A11Q8NBS3 891 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TATDN2Q93075 761 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TMEM176AQ96HP8 235 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ARID3AQ99856 593 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 GABRG3Q99928 467 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CD248Q9HCU0 757 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CISHQ9NSE2 258 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 RASAL2Q9UJF2 1139 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 RAD54BQ9Y620 910 aa17.78■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CETN3O15182 167 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 HMBSP08397 361 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 EPB41P11171 864 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 NDUFV2P19404 249 aa17.77■□□□□ 0.44
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