RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 MYF5P13349 255 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PNPLA4P41247 253 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 COPAP53621 1224 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 UCNP55089 124 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 VAC14Q08AM6 782 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM29Q14134 588 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 KRT79Q5XKE5 535 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 BIRC7Q96CA5 298 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 P2RY11Q96G91 374 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PCED1BQ96HM7 432 aa16.5■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRJQ12913 1337 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 LAD1O00515 517 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ITGAVP06756 1048 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 C1SP09871 688 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ABCB4P21439 1286 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PPP3CCP48454 512 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 LHX1P48742 406 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SHBQ15464 509 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 IL17AQ16552 155 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 HIC2Q96JB3 615 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 RELNP78509 3460 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 MYH10P35580 1976 aa16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PLXNA2O75051 1894 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 H0YCG3 227 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 IGLV3-19P01714 112 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PRKCHP24723 683 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SLC12A3P55017 1021 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ARSHQ5FYA8 562 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 FBXO32Q969P5 355 aa16.48■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CDK4P11802 303 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 GP1BBP13224 206 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 C21orf59P57076 290 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 GEN1Q17RS7 908 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 HECTD3Q5T447 861 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 MYCT1Q8N699 235 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 EXD3Q8N9H8 876 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CXorf38Q8TB03 319 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SAP25Q8TEE9 199 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 C8orf48Q96LL4 319 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SLC6A18Q96N87 628 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 REEP2Q9BRK0 252 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 EHD2Q9NZN4 543 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CDH9Q9ULB4 789 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 NME7Q9Y5B8 376 aa16.47■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CKAP5Q14008 2032 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CREBBPQ92793 2442 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 CLDN5O00501 218 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 GREM1O60565 184 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PLA2G4BP0C869 781 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 YWHAQP27348 245 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 PGFP49763 221 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 GABREP78334 506 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ORC1Q13415 861 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 NACA2Q9H009 215 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 ZHX3Q9H4I2 956 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 SIX4Q9UIU6 781 aa16.46■□□□□ 0.23
ALYREF-204ENST00000512673 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
ALYREF-204ENST00000512673 TSPAN3O60637 253 aa16.45■□□□□ 0.22
ALYREF-204ENST00000512673 SEMA4FO95754 770 aa16.45■□□□□ 0.22
ALYREF-204ENST00000512673 WNT1P04628 370 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms