RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 CUL5Q93034 780 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 ZBTB9Q96C00 473 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 KAZALD1Q96I82 304 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 FZD4Q9ULV1 537 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 MAFFQ9ULX9 164 aa4.91□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 A0A087WZ62 844 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PRAMEF2O60811 474 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 WDR47O94967 919 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 FGBP02675 491 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ATICP31939 592 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 NR4A2P43354 598 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF91Q05481 1191 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SHC4Q6S5L8 630 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 P3H2Q8IVL5 708 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 COQ8BQ96D53 544 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 LRRC46Q96FV0 321 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 POM121BA6NF01 834 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KPNA5O15131 536 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF543Q08ER8 600 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MTAPQ13126 283 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 C10orf25Q5T742 122 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 HMCESQ96FZ2 354 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 HIC2Q96JB3 615 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 VPS45Q9NRW7 570 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 FAM50BQ9Y247 325 aa4.89□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 AREL1O15033 823 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 COQ9O75208 318 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 GALNSP34059 522 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 YPEL5P62699 121 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 DNASE1L3Q13609 305 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ACOX1Q15067 660 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ANO7Q6IWH7 933 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KRT73Q86Y46 540 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CLCA1A8K7I4 914 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SOCS2O14508 198 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ARP10275 920 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 FGFR2P21802 821 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TACR3P29371 465 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PBX1P40424 430 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CASP5P51878 434 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 JAK3P52333 1124 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CFHR1Q03591 330 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 GPS1Q13098 491 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 LAMB3Q13751 1172 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 RNF152Q8N8N0 203 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 NRACQ8N912 160 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 NUAK2Q9H093 628 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 VPS4AQ9UN37 437 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SLC5A1P13866 664 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PRF1P14222 555 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TSHRP16473 764 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PRIM2P49643 509 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 DGKQP52824 942 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ID2Q02363 134 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KCNJ12Q14500 433 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms