RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 GBP5Q96PP8 586 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM4Q9C037 500 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SCOCQ9UIL1 159 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MYO9BQ13459 2157 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 F8VZ95 297 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 O00370 1275 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NFIBO00712 420 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PDXKO00764 312 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DIAPH2O60879 1101 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PHF2O75151 1096 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NPTXRO95502 500 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TDP2O95551 362 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ACSL3O95573 720 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CFIP05156 583 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM253P0C7T8 217 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CSH1P0DML2 217 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CSH2P0DML3 217 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GJC1P36383 396 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PBX2P40425 430 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZP2Q05996 745 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADCY1Q08828 1119 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FUT2Q10981 343 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMD6Q15008 389 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EPHA7Q15375 998 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC80Q76M96 950 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 JAMLQ86YT9 394 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TEX9Q8N6V9 391 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ACAP3Q96P50 834 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 UCN2Q96RP3 112 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MED10Q9BTT4 135 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MIS12Q9H081 205 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MKS1Q9NXB0 559 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 STOML1Q9UBI4 398 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CA14Q9ULX7 337 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD28-213ENST00000498524 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 H0Y858 1186 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRN2O75325 713 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RASGRP1O95267 797 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 APBB3O95704 486 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 BRAFP15056 766 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SOX5P35711 763 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MASP1P48740 699 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNQ1P51787 676 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RWDD2BP57060 319 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NKX3-2P78367 333 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DBN1Q16643 649 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ATCAYQ86WG3 371 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TPH2Q8IWU9 490 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 GDAP1Q8TB36 358 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR152Q8TDT2 470 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PGM2Q96G03 612 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC12Q9UKB3 198 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 USP20Q9Y2K6 914 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH6P13533 1939 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH7P12883 1935 aa4.08□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.08□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 BTNL10A8MVZ5 291 aa4.08□□□□□ -1.76
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