RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TNIP3Q96KP6 325 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS9Q9BPW9 319 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BRB1 525 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 BRINP1O60477 761 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGB1P05556 798 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 APOA4P06727 396 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MYZAPP0CAP1 466 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HPCAP84074 193 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP4P98171 946 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TAP1Q03518 808 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PTK2Q05397 1052 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZACNQ401N2 412 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 RTP2Q5QGT7 225 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF220Q5VTB9 566 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PALM2Q8IXS6 379 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ABI1Q8IZP0 508 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CALML6Q8TD86 181 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HIC2Q96JB3 615 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 WACQ9BTA9 647 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PXMP2Q9NR77 195 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HPF1Q9NWY4 346 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DNM3Q9UQ16 869 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEB16A2A368 324 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 VSTM5A8MXK1 200 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM114B3SHH9 223 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 B4E1Z4 1266 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DCXO43602 365 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SLITRK3O94933 977 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CKBP12277 381 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 EDNRBP24530 442 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPN9P43378 593 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCG1P45844 678 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFV1P49821 464 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 EPHB1P54762 984 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB16Q05516 673 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C19orf57Q0VDD7 668 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NCSTNQ92542 709 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SYT15Q9BQS2 421 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 KATNBL1Q9H079 304 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 UCK1Q9HA47 277 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3D21A4FU49 640 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FBP2O00757 339 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP10O43572 662 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R37O75864 691 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ASLP04424 464 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA2BP08514 1039 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 RARGP13631 454 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PDGFRAP16234 1089 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 M6PRP20645 277 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ACADVLP49748 655 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf54Q08AI8 447 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKG2Q13237 762 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP2R5DQ14738 602 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LY6KQ17RY6 165 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM154Q6P9G4 183 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL7BQ6UX53 244 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C4orf22Q6V702 233 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 AZIN2Q96A70 460 aa4.74□□□□□ -1.65
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