RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 CYP11B2P19099 503 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RARRES1P49788 294 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SELENOPP49908 381 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 EPHB1P54762 984 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 NPEPPSP55786 919 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 TUSC3Q13454 348 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 DGKDQ16760 1214 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 GPBP1Q86WP2 473 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MIB1Q86YT6 1006 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 COG1Q8WTW3 980 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 GLG1Q92896 1179 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 C16orf92Q96LL3 132 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 TRIM9Q9C026 710 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 AZI2Q9H6S1 392 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ZMAT4Q9H898 229 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 POLD4Q9HCU8 107 aa6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ACOT7O00154 380 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SCDO00767 359 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 KCNK3O14649 394 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 GPR42O15529 346 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 KLRC4O43908 158 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MYL1P05976 194 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MYL3P08590 195 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC9A1P19634 815 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CPT1AP50416 773 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 KIF11P52732 1056 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ASIC1P78348 528 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 NKX3-2P78367 333 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MCL1Q07820 350 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 PLCB4Q15147 1175 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 XKR9Q5GH70 373 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 XKR3Q5GH77 459 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 BROXQ5VW32 411 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ISM2Q6H9L7 571 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RASSF3Q86WH2 238 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 PASD1Q8IV76 773 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SPATA20Q8TB22 786 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 KAT2BQ92831 832 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SMARCE1Q969G3 411 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CEP170P1Q96L14 293 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 REEP2Q9BRK0 252 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 HAS3O00219 553 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 HBP1O60381 514 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SMC2O95347 1197 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 LTFP02788 710 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 RSPH10BP0C881 870 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 IDEP14735 1019 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 LSP1P33241 339 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC26A2P50443 739 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 NEK2P51955 445 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 SOX10P56693 466 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 ITKQ08881 620 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 COASYQ13057 564 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 MORC3Q14149 939 aa6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1-218ENST00000495588 GIT2Q14161 759 aa6.03□□□□□ -1.44
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