RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495354.1

ARF4-208, Transcript of ADP ribosylation factor 4, human

TSL 3

Gene ARF4, Length 495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARF4-208	ENST00000495354	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MEI4	A8MW99	385 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	RALA	P11233	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CHKA	P35790	457 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	NDST1	P52848	882 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ZACN	Q401N2	412 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	SHC4	Q6S5L8	630 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	TMC2	Q8TDI7	906 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	KLK13	Q9UKR3	277 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354		A0A1B0GTW7	788 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	IKBKB	O14920	756 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CYBB	P04839	570 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MYL1	P05976	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	RARG	P13631	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ADORA2B	P29275	332 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CD6	P30203	668 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	OXTR	P30559	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ME1	P48163	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	COG7	P83436	770 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	INCA1	Q0VD86	236 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ZNF276	Q8N554	614 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	DEFB119	Q8N690	84 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	SDCBP2	Q9H190	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MYH10	P35580	1976 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	PDXK	O00764	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	TRIM24	O15164	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	MAPK13	O15264	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CYP26A1	O43174	497 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	GREM1	O60565	184 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	BEST1	O76090	585 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	VNN1	O95497	513 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CER1	O95813	267 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CD59	P13987	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	AFM	P43652	599 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ASPA	P45381	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CUL4B	Q13620	913 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354		Q6ZNB5	142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	NAXD	Q8IW45	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	ACOX2	Q99424	681 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CD248	Q9HCU0	757 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	NAGPA	Q9UK23	515 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	LHX6	Q9UPM6	363 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	RAD54B	Q9Y620	910 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354		A0A1W2PQH9	124 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	TBX18	O95935	607 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ARF4-208	ENST00000495354	NR3C1	P04150	777 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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