RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 F5H423 210 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 DPYSL4O14531 572 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 KRT16P08779 473 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 STILQ15468 1287 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 GALNTL6Q49A17 601 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 HHATQ5VTY9 493 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TTC39CQ8N584 583 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 RNF217Q8TC41 542 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MAGEC3Q8TD91 643 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PHTF1Q9UMS5 762 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 A6NJR5 290 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 AP1G2O75843 785 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CYP2F1P24903 491 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 RABGGTBP53611 331 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PDK2Q15119 407 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CCDC185Q8N715 623 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 KLHL14Q9P2G3 628 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 DERAQ9Y315 318 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TEX264Q9Y6I9 313 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 KPNA7A9QM74 516 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 NDC80O14777 642 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MAP3K13O43283 966 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ZBED1O96006 694 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 L1CAMP32004 1257 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 FAAP100Q0VG06 881 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SNX17Q15036 470 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CCL14Q16627 93 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ETNK1Q9HBU6 452 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CNTN3Q9P232 1028 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 NRCAMQ92823 1304 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PIRO00625 290 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 F2P00734 622 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 APRTP07741 180 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 BNIP1Q12981 228 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MFSD10Q14728 455 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PDK4Q16654 411 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 UBXN11Q5T124 520 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SLC9A4Q6AI14 798 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SERAC1Q96JX3 654 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CLDN5O00501 218 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 METTL18O95568 372 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SETSIPP0DME0 302 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 AMPD1P23109 780 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SPRYD7Q5W111 196 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 OSTM1Q86WC4 334 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TEKT4Q8WW24 435 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TBCBQ99426 244 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PLAC1Q9HBJ0 212 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SENP1Q9P0U3 644 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MYL3P08590 195 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 GRIA1P42261 906 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 RASA2Q15283 850 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 FAM110CQ1W6H9 321 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 TLK2Q86UE8 772 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 UNC93AQ86WB7 457 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CYTH2Q99418 400 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SNX25Q9H3E2 840 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 COX16Q9P0S2 106 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 PAK5Q9P286 719 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 UGT1A9O60656 530 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-213ENST00000492657 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms