RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 VNN1O95497 513 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FESP07332 822 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RHOP08100 348 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MMP8P22894 467 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 GKP32189 559 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 UBE3AQ05086 875 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA3BQ13214 749 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC3Q13507 836 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ12Q14500 433 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL20Q96IG2 436 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 COG8Q96MW5 612 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 DERAQ9Y315 318 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PIPSLA2A3N6 862 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KIF28PB7ZC32 967 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PMPCBO75439 489 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KRT38O76015 456 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RXRAP19793 462 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TPTEP56180 551 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 VAMP2P63027 116 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A1Q13621 1099 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RETSATQ6NUM9 610 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CPOQ8IVL8 374 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ESX1Q8N693 406 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PBKQ96KB5 322 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf173Q96LM9 149 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 GGA3Q9NZ52 723 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 BAG5Q9UL15 447 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MPPED1O15442 326 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ERBB2P04626 1255 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CREB1P16220 341 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 FOLR3P41439 243 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CLCN2P51788 898 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 PDE1AP54750 535 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD1Q15327 319 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 DENND2CQ68D51 928 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 P3H2Q8IVL5 708 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 USP38Q8NB14 1042 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ASB10Q8WXI3 467 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SKA1Q96BD8 255 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 FAR2Q96K12 515 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CHODLQ9H9P2 273 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 GABRQQ9UN88 632 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CHRM2P08172 466 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 JUPP14923 745 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ADRA1DP25100 572 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 BFSP2Q13515 415 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 VPS45Q9NRW7 570 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 WDR27A2RRH5 827 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT4O43236 478 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS11DO60235 418 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-212ENST00000491302 CTSWP56202 376 aa8.68□□□□□ -1.02
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