RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 PTPRJQ12913 1337 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 USP24Q9UPU5 2620 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SPTLC2O15270 562 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 STX6O43752 255 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CER1O95813 267 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 HMBSP08397 361 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SERPINF2P08697 491 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC130P13994 396 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TYRP14679 529 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 GABRG2P18507 467 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 AFMP43652 599 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TUBP50607 506 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 AP3M2P53677 418 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CDH8P55286 799 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ORC1Q13415 861 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 NCOA4Q13772 614 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ACAP1Q15027 740 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC39A14Q15043 492 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CEP135Q66GS9 1140 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ACOT1Q86TX2 421 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 MIB1Q86YT6 1006 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 FRMD1Q8N878 549 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 KCNK16Q96T55 309 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 STRA6Q9BX79 667 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TRIM9Q9C026 710 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CIPCQ9C0C6 399 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 MAGEF1Q9HAY2 307 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 RAD54BQ9Y620 910 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TCHHQ07283 1943 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A1W2PQD8 194 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CYP26A1O43174 497 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CUTAO60888 179 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ADAM23O75077 832 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 OLFM2O95897 454 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM163BP0C2L3 166 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 NCAM1P13591 858 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 KRT13P13646 458 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CD58P19256 250 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 NDUFV2P19404 249 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SYT1P21579 422 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CD6P30203 668 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CASP4P49662 377 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 NDST1P52848 882 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CACNA2D1P54289 1103 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ZXDBP98169 803 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TEAD4Q15561 434 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 INAVAQ3KP66 663 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 MSS51Q4VC12 460 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 UNC13DQ70J99 1090 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM124AQ86V42 546 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM25Q86YD3 366 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 NAXDQ8IW45 347 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 GANCQ8TET4 914 aa5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
AC004889.1-208ENST00000489077 USP28Q96RU2 1077 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms